不按工资缴纳社保是违法的。依据《社会保险法》，未足额缴付社保属违法行为，社保征收机构可责令限期缴纳或补足。若长期不改正，将影响员工权益，可能导致法律纠纷及企业信誉受损。
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不按工资缴纳社保需改正。具体操作：1. 核实员工实际工资与社保缴纳基数是否一致；2. 若不一致，立即按实际工资调整社保缴纳基数并补缴差额；3. 告知员工补缴情况，确保员工权益不受损；4. 定期检查社保缴纳情况，避免类似问题再次发生。
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处理不按工资缴纳社保的常见方式是补缴或改正。企业应尽快按实际工资补缴社保，以避免法律风险和员工权益受损。若企业拒绝改正，员工可向社保征收机构举报。